A nivell cel lular, la tomografia permet interpretar de forma molt encertada la funció biològica de les macromolècules que s'estan estudiant. Per a això es necessita conèixer l'estructura tridimensional, no només de les macromolècules que es troben a l'interior, sinó també la de la pròpia cèl·lula. Al Centre Nacional de Biotecnologia del CSIC per exemple, Cristina Risco estudia l'organització en tres dimensions dels components cel lulars que els virus manipulen dins de la cèl·lula que han infectat. Per la seva banda, José Jesús Fernández treballa en el mateix centre estudiant les diferències en l'estructura dels components mòbils quan es pateix alguna malaltia neurodegenerativa.

Inicialment, per poder processar l'enorme quantitat d'informació obtinguda, ordenant i ajustant cada una de les imatges en la posició que ocupen una respecte a les altres, es feia necessari l'ús de multitud d'ordinadors connectats en xarxa. No obstant això, el programari disponible en l'actualitat requereix només la instal lació de targetes gràfiques. Amb elles s'aconsegueix processar les dades obtingudes en diferents plans bidimensionals. D'aquesta manera, la tomografia ens permet construir un model tridimensional bastant real.

No obstant això, la necessitat d'un maquinari específic fa que no tots els ordinadors puguin ser utilitzats i fins i tot, encara que es disposi d'una targeta gràfica compatible, a l'hora dur a terme els processos de càlcul requerits, aquesta ha de tenir unes característiques determinades que la facin funcional. Per facilitar la tasca dels científics, en el grup de recerca de José Jesús Fernández han optimitzat tant el codi de programació, com l'aprofitament de totes les capacitats dels ordinadors estàndard actuals. Combinant una tècnica de computació vectorial amb l'ús d'un procediment multi-thread mitjançant l'ús de microprocessadors multinucli, sense la necessitat de cap maquinari addicional, amb qualsevol ordinador que tingui aquest tipus de processador, instruccions SIMD i una bona memòria de memòria cau, es pot fer una reconstrucció tridimensional amb la mateixa velocitat que si s'hagués instal lat una targeta gràfica. Per això només es requereix una gran quantitat d'imatges bidimensionals dels diferents plans de la mostra a estudiar.

El mètode de càlcul que han desenvolupat, a més d'alta velocitat i una resolució nanomètrica, suposa una gran versatilitat de cara a la creació de programari per reconstruir en tres dimensions les dades obtingudes amb la tomografia per part de qualsevol altre programador. A més, en no ser necessària la instal lació ni de targetes gràfiques ni de xarxes d'ordinadors, es facilita la tasca dels metges i biòlegs que necessitaran la informació de les estructures cel lulars en tres dimensions. No els cal l'ajuda d'experts en informàtica per a treballar amb la informació estructural que els proporciona la tomografia. Només necessiten instal lar un programa als seus ordinadors.

Encara que al principi ha estat desenvolupat amb la idea de resoldre les estructures tridimensionals dels components cel lulars, el programari és vàlid en qualsevol situació en què es vulgui reconstruir una estructura tridimensional en poc temps (tomografia computada, tomografia electrònica; tomografia de raigs X ; tomografia òptica, etc.). Per això, pot ser utilitzada tant per biòlegs o metges, com per qualsevol altre científic o enginyer que treballi en l'estudi de materials.