Genética 18 Figura 3. Laboratorio de análisis transcriptómico del Grupo de Mejora Genética de Frutales del CEBAS-CSIC de Murcia: 1. Placas PCR; 2. Puntas de pipeta con filtro; 3. Kits de extracción de ARN y amplificación mediante qPCR; 4. Reactivos; 5. Tubos Eppendrof; 6. Termociclador convencional PCR semicuantiativa; 7. Micropipetas; 8. Vórtex; 9. Nanodrop; 10. Minifuga; 11. Biofotómetro; 12. Termociclador PCR cuantitativa (qPCR); 13 Centrífuga; 14. Ultracentrífuga refrigerada. contexto (post-genómico) se presentan una serie de nuevos desafíos biológicos y oportunidades en la apli- cación de toda la gama de las ciencias ómicas como la transcriptómica, en el desarrollo de estrategias efi- caces de selección asistida por marcadores en Prunus. Estas oportunidades son de especial interés en el caso de Prunus, donde el conocimiento de la asociación entre genes y caracteres agronómicos es bastante limitado. En este contexto, se ha puesto en marcha un laboratorio de análisis transcriptómico de frutales de hueso dentro del Grupo de Mejora Genética de Frutales del CEBAS-CSIC de Murcia (Figura 3). Este laboratorio tiene como objetivo el análisis transcriptó- mico en frutales del género Prunus y el desarrollo de aplicaciones a los programas de mejora. Está dedicado a los trabajos de extracción del RNA para su poste- rior envío a los diferentes servicios de secuenciación masiva tanto de mRNA como de miRNA existentes en España y Europa; además del análisis bioinformático de los datos obtenidos mediante secuenciación y la validación de los datos obtenidos mediante RT-PCR cuantitativa (qPCR) o semicuantitativa (RT-PCR) ensa- yando los genes de interés uno a uno. Aplicación de las técnicas de análisis transcriptómico en los programas de mejora de frutales En el caso de especies del género Prunus, la secuen- ciación del transcriptoma (RNA-Seq) ha sido aplicada en melocotonero para facilitar y aislar genes que controlan diferentes caracteres agronómicos del árbol y el fruto (Wang et al., 2013; Chen et al., 2014; Sanhueza et al., 2015). También se ha utilizado para estudiar los genes implicados en la patogénesis de Xanthomonas arboricola (Socquet-Juglard et al., 2013) o Lasiodiplodia theobromae (Gao et al., 2016) en melocotonero. En otras especies, esta tecnología ha sido utilizada en el análisis de expresión génica de la dormancia de la yema en albaricoquero japonés (Zhong et al., 2013), el desarrollo del fruto (Alkio et al., 2014) y calidad del fruto (Wei et al., 2015) en cerezo dulce, o la resistencia al frío en almendro (Mousavi et al., 2014). Un ejemplo reciente de aplicación de esta técnica de RNA-Seq para el mejor conocimiento de los procesos biológicos y moleculares asociados a la expresión de los caracteres de interés agronómico es la expresión de la susceptibilidad/resistencia a Plum pox virus (PPV, sharka) en frutales del género Prunus (Rubio et al. 2015a; 2015b). Estos estudios pusieron de manifiesto que la respuesta temprana a la infección por PPV en melocotonero y albaricoquero está asociada a una inducción de genes relacionados con la resistencia a patógenos como ácido jasmónico, proteínas de resistencia, qui- tinasas, citoquininas o proteínas Lys-M. En cambio, cuando el virus se había establecido, se observaba una sobreexpresión de genes Dicer protein 2a que